10.4 Prueba de PCR en el diagnostico de enfermedades
Genéticas Por microorganismos (bacterianas, protozoarios, entre otros)
Las aplicaciones
actuales de la biología molecular para el diagnóstico clínico son muy variadas:
Genética
- Diagnóstico prenatal
- Tipaje de HLA
- Reordenamientos genéticos
- Detección de esperma aneuploide
- Creación de mapas genéticos
Diagnóstico
Microbiológico
* Diagnóstico rápido de infecciones
víricas
* Detección de microorganismos en células
infectadas/transformadas
* Determinación de la relación génetica
entre varios tipos de microorganismos similares
* Correlacionar la presencia/expresión de
agentes virales/infecciosos en tejidos neoplásicos.
* Determinar la resistencia a los
antibióticos de las bacterias.
* Epidemiología de las infecciones
* Detectar y cuantificar microorganismos
difíciles de cultivar o para los que no existen reactivos serológicos.
* Detectar regiones transformantes
específicas en virus
Diagnóstico y
clasificación de neoplasias y establecimiento de un pronóstico
· Detectar reordenamientos de genes
· Detectar reordenamientos en tumores humanos
con anomalías consistentes cariotípicas
· Detectar reordenamientos
moleculares/anomalías de expresión genética en ausencia de alteraciones del
cariotipo
· Estudio de la estructura/expresión de
oncogenes
· Detección de amplificación
genética/resistencia a drogas
· Diagnóstico de cell lineage en base a
la expresión genética
APLICACIONES PCR
Esta técnica permite multiplicar ("amplificar" es, en realidad, el término
que se ha impuesto) pequeñas cantidades de ADN entre cientos de miles y millones
de veces. El tramo destinado a reproducirse puede tener desde cincuenta hasta
más de dos mil nucleótidos de longitud. El segmento de ADN que sirve de molde
no requiere estar necesariamente en estado puro, sino que puede ser parte
de mezclas complejas. Puede ser, por ejemplo, ADN nuclear total.
El método se basa, en su forma más simple en la realización de tres reacciones
sucesivas llevadas a cabo a distintas temperaturas. Estas reacciones se repiten
cíclicamente entre veinte y cuarenta veces. La muestra
se calienta, en el primer paso, hasta lograr la separación de las dos cadenas
que constituyen el ADN, hecho que se conoce como "desnaturalización". En el
segundo paso, la temperatura se reduce para permitir el "apareamiento" de
cada una de dos cadenas cortas de nucleótidos (oligonucleóridos) con cada
una de las hebras separadas del ADN molde. Se trata de segmentos de ADN de
cadena simple, sintetizados en el laboratorio y diseñados de manera tal que
permiten definir los límites del tramo de ADN que se desea replicar. Obviamente,
para que se pueda producir el apareamiento, cada uno de estos oligonucleótidos,
a los que se denomina "iniciadores" o primers, debe ser complementario
del tramo al que tienen que unirse en las cadenas separadas del ADN molde.
En tercer lugar, una enzima ADN polimerasa extiende los primers, en
el espacio comprendido entre ambos, sintetizando las secuencias complementarias
de las hebras del ADN molde. Para ello, la ADN polimerasa usa desoxidonucleósidos
trifosfato (dNTPs) agregados a la mezcla de reacción. La temperatura a la
que se realiza el tercer paso está condicionada por aquélla a la cual "trabaja"
la enzima ADN polimerasa. Al cabo del primer ciclo de tres reacciones (desnaturalización,
apareamiento, extensión) el tramo de ADN elegido se ha duplicado y el doble
de su cantidad original se encuentra disponible para ser nuevamente replicado
en un segundo ciclo. El resultado de la aplicación de numerosos ciclos "en
cadena" da lugar a la amplificación geométrica del segmento de ADN delimitado
por los primers.
BIBLIOGRAFIA
http://www.cienciahoy.org.ar/hoy23/reaccion.htm
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